Конфликт возник из-за неопределенности в Налоговом кодексе, действовавшей до 2025 года. Ранее российские экспортеры сельхозпродукции руководствовались правилом, позволяющим не платить налог за иностранных контрагентов, не имеющих постоянного представительства в стране. Позицию бизнеса подтверждало официальное письмо Минфина от 2014 года, а суды вставали на сторону налогоплательщиков. Однако после выпуска нового разъяснения финансового ведомства налоговые органы изменили подход и начали требовать уплаты 10% с каждой операции задним числом.

Ситуация усугубляется противоречивой судебной практикой: суды внутри одного округа выносят полярные решения, что лишает бизнес предсказуемости. Гендиректор «Новосибирскхлебопродукт» Сергей Соколов подчеркивает, что аграрии оказались в сложном положении из-за проблем с логистикой в Азовско-Черноморском бассейне и одновременного давления со стороны фискальных органов. В свою очередь, иностранные перевозчики начали закладывать налоговые риски в стоимость услуг или вовсе отказываться от работы с российской юрисдикцией.

Эксперты отмечают, что текущий фискальный курс сместился в сторону пополнения бюджета в ущерб поддержке аграрного сектора. Партнер «МЭФ Legal» Вадим Зарипов скептически оценивает шансы на успех обращения в Генпрокуратуру, полагая, что влияние надзорного ведомства на решения Верховного суда в данном вопросе будет ограниченным.